Povestea din Fortune Arterial se învârte în jurul protagonistului Kohei Hasekura, care se transferă într-o prestigioasă școală publică de șase ani englezească care cuprinde elevi de școală gimnazială și liceeni. Școala se află pe o insulă numită Insula Tamatsu, departe de țărâm, de pe continentul Japonia, iar singura cale ca să ajungi acolo este cu barca. Curând după ce s-a transferat, a descoperit că un elev din clasa de lângă el, Sendo Erika, este de fapt un fel de vampir.