În Japonia feudală, locuitorii din Edo sunt asediați de insecte gigantice care fac ravagii pe pământ. Oamenii imploră cu disperare guvernul să facă ceva în acest sens. Astfel, se înființează Biroul Magistraturii Insectelor, care adună războinici puternici pentru a se apăra împotriva apariției dăunătorilor. Mushibugyou îl urmărește pe Jinbee Tsukishima, un tânăr care se străduiește să devină un maestru spadasin precum tatăl său. Pentru a ispăși un incident îngrozitor care a avut loc din vina sa, Jinbee caută să ia locul tatălui său ca membru al Biroului Magistraturii Insectelor. În călătoria sa acolo, o întâlnește pe frumoasa Haru, o tânără care ajută la administrarea casei de ceai a familiei sale, și este nevoit să își folosească sabia pentru a o salva de la o soartă macabră. Acest act de curaj îi aduce un loc în Magistratura Insectelor. Va reuși oare acest exterminator începător să scape țara de hoardele de insecte ce mișună în orașe?